Полное секвенирование экзома: что это и зачем нужно

Полное секвенирование экзома - один из наиболее информативных методов генетической диагностики, который позволяет прочитать все кодирующие участки ДНК за один анализ. В отличие от точечных тестов, экзомный анализ охватывает около 20 000 генов и выявляет мутации, связанные с сотнями наследственных заболеваний.

Что такое экзом и почему его изучают

Экзом - совокупность всех экзонов: участков генома, кодирующих белки. Он составляет около 1,5% от общей длины ДНК, но именно здесь сосредоточено примерно 85% клинически значимых мутаций. Лаборатория фокусируется на этой функционально важной части вместо чтения всего генома - это быстрее и дешевле полногеномного секвенирования.

• Экзом содержит порядка 180 000 экзонов из примерно 20 000 генов
• Большинство моногенных болезней обусловлено именно экзонными мутациями
• Анализ стоит дешевле и выполняется быстрее полногеномного варианта

Когда назначают экзомное секвенирование

К этому методу обращаются, когда стандартные тесты не дают ответа. Ребёнок с задержкой развития, несколько выкидышей без очевидной причины, редкий синдром без диагноза - во всех этих случаях экзом находит то, что другие методы пропускают. Анализ назначают и взрослым при подозрении на наследственные болезни обмена веществ или первичные иммунодефициты.

• Невыясненные задержки умственного или физического развития у детей
• Подозрение на наследственные онкологические синдромы
• Редкие болезни, долго остающиеся без диагноза («диагностические одиссеи»)

Как проходит анализ и что получает пациент

Для исследования берут кровь или слюну. Лаборатория обогащает целевые участки, проводит высокопроизводительное секвенирование и сравнивает данные с референсным геномом. Итоговый отчёт содержит перечень выявленных вариантов с указанием клинической значимости - патогенные, вероятно патогенные или варианты неопределённой значимости (VUS). Интерпретацию проводит врач-генетик.

• Биоматериал: венозная кровь или образец слюны
• Срок выполнения: от 4 до 8 недель
• Отчёт включает клиническую интерпретацию и рекомендации

Заключение

Секвенирование экзома расширило возможности генетической диагностики: многие пациенты получают ответ после многолетних обследований. Метод имеет ограничения - он не охватывает некодирующие регионы и структурные перестройки хромосом, поэтому врач-генетик всегда оценивает его уместность в конкретной ситуации.