В июне 2006 года Управлением Федеральной регистрационной службы по Томской области проведена проверка уставной деятельности Томского регионального отделения политической партии «Российская экологическая партия «Зеленые».
Как сообщила пресс-служба Управления Федеральной регистрационной службы по Томской области, по итогам проверки в адрес регионального отделения вынесено предупреждение о нарушении требований положений п. 2 ст. 23 ФЗ «О политических партиях», в связи с принятием в ряды партии 3-х граждан, не достигших совершеннолетия.