По мнению главы Минэкономразвития Германа Грефа Сибири необходима модернизация транспортной системы. В частности, создание сети аэропортов-хабов, которые можно было бы использовать как перевалочные пункты для перевозки грузов, а также больших пассажиропотоков. Расположение таких аэропортов именно в Сибири, на взгляд Германа Грефа, будет более эффективным с точки зрения выстраивания новой инфраструктуры.
Организация подобной современной транспортной системы, кроме всего прочего, позволит России выйти на рынки Азиатско-тихоокеанского региона. По ряду других целевых программ, которые реализуются или будут реализовываться в СФО, предусмотрена также модернизация ряда энергомощностей на территории Сибири.