По оперативным данным по итогам 3-х месяцев 2006 года доходы областного бюджета составили 3826,4 млн. рублей, расходы - 3870 млн. рублей. По данным пресс-службы обладминистрации, на 1 апреля в областном бюджете сложился дефицит 43,6 млн. рублей.
Собственные доходы составили 84,9%, или 3 млрд. 247,4 млн. рублей, в том числе налоговые доходы - 3 млрд. 130,4 млн. рублей, неналоговые - 117 млн. рублей. Безвозмездные перечисления из федерального бюджета - 579 млн. рублей. В структуре доходов наибольший удельный вес за отчетный период пришелся на налог на прибыль организаций - 1 млрд. 709,3 млн. рублей (52,6%), налог на доходы физических лиц - 715 млн. рублей (22%), налоги на имущество - 144 млн. рублей (4,4%), налог на добычу полезных ископаемых - 271,3 млн. рублей (8,4%), акцизы - 230,7 млн. рублей (7,1%).
Основными статьями расходов за 3 месяца стали: финансовая помощь местным бюджетам - 1 млрд. 703,7 млн. рублей; социальная политика - 530,3 млн. рублей; транспорт, сельское хозяйство и другие вопросы в области экономики - 318,4 млн. рублей; здравоохранение и спорт - 582,7 млн. рублей; образование - 246,9 млн. рублей; правоохранительная деятельность, предупреждение и ликвидация ЧС - 215,9 млн. рублей; культура - 29,7 млн. рублей.
Государственный внутренний долг Томской области увеличился с начала года на 22% и составил на 1 апреля 3 млрд. 465 млн. 872 тыс. рублей, в том числе кредиты коммерческих банков - 649 млн. 730 тыс. рублей, государственные ценные бумаги - 2 млрд. 141 млн. 623 тыс. рублей, бюджетные кредиты - 292 млн. 151 тыс. рублей, государственные гарантии - 382 млн. 368 тыс. рублей.