По данным департамента финансов Томской области, по итогам 10 месяцев 2006 года доходная часть областного бюджета Томской области составила 16349,2 млн. рублей, расходная - 15658,8 млн. рублей. По итогам 10 месяцев в областном бюджете сложился профицит (превышение доходов над расходами) 690,4 млн. рублей.
Собственные доходы областного бюджета за 10 месяцев составили 83,67%, или 13679 млн. руб. Наибольшие поступления приходятся на налог на прибыль организаций (6066,3 млн. руб., или 44,35% от общих доходов) и налог на доходы физических лиц (2980,8 млн. руб., или 21,79%). От налога на добычу полезных ископаемых в областной бюджет поступило 976,4 млн. руб., или 7,14% от всех доходов, от акцизов - 923,8 млн. руб., или 6,75%. Неналоговые доходы составили 546,1 млн. руб. (3,99%).
16,33% доходов областного бюджета (2670,2 млн. руб.) приходятся на безвозмездные перечисления из федерального бюджета и иные безвозмездные перечисления.
По итогам 10 месяцев на межбюджетные трансферты израсходовано 6480,7 млн. руб., на социальную политику - 2001,3 млн. руб., на транспорт, сельское хозяйство и другие вопросы в области экономики - 1719,6 млн. руб. Расходы областного бюджета на здравоохранение и спорт составили 1985,5 млн. руб., образование - 1074,9 млн. руб. На правоохранительную деятельность, предупреждение и ликвидацию ЧС направлено 989,6 млн. руб., на культуру - 131,1 млн. руб.
На 1 ноября 2006 года государственный долг Томской области составил 2848 млн. руб., в том числе: кредиты коммерческих банков - 708 млн. руб., государственные ценные бумаги - 1670 млн. руб., бюджетные кредиты - 162 млн. руб., государственные гарантии - 308 млн. руб.