Построен по проекту архитектора А.И. Лангера и освящен в 1911 г. Архитектура собора выдержана в псевдорусском стиле. Южный придел собора посвящался памяти Второго обретения Честной Главы Святого Иоанна Предтечи - ангела Томского городского головы Ивана Некрасова, жертвователя на постройку храма. Северный придел посвящался празднику Рождества Пресвятой Богородицы. Специально к освящению собора в Томск были доставлены с Афона четыре иконы на кипарисовых досках: "Введение во храм Пресвятой Богородицы", "Рождество Христово", "Усекновение Главы Иоанна Предтечи" и "Покров Пресвятой Богородицы". Иконы были выполнены Афонскими монахами-иконописцами по заказу Ивана Некрасова. В 9130-е годы в соборе располагалась кафедра обновленческого архиепископа Томского Сергия Дмитриевского.
Особое внимание богомольцев, приходящих в храм, привлекает образ святителя Николая, выставленный в опаленный огнем кивот. В 1985 году в соборе вспыхнул пожар. Огонь стал быстро распространяться по храму, безжалостно уничтожая церковную утварь и другие храмовые принадлежности. Однако разбушевавшееся пламя, дойдя до иконы святителя Николая и частично опалив кивот, внезапно было остановлено молитвами Угодника Божия без всяеого человеческого вмешательства. В память о чудесном спасении храма было решено не менять обгоревший кивот и до сего дня обрамляющий святой образ.
Адрес: г. Томск, ул. Алтайская, 47
Телефон: 53-15-68